先天性甲狀腺低能症(congenital hypothyroidism)最常見的原因為:
甲狀腺發育不全(aplasia)
甲狀腺異位(ectopia)
甲狀腺過氧化酶缺損(thyroid peroxidase defect)
甲狀腺促素缺乏(TSH deficiency)