藥物對酵素作用為不可逆的抑制 (irreversible inhibition) 為:
penicillin 與 lysozyme 的 serine 結合
磺胺劑對 folate synthase 的 p-amino benzoic acid 結合位
diisopropyl fluorophosphate (DIFP) 與 trypsin 的 serine 結合
cyanide 與 glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase 的 cysteine 結合